黃炎培找到蔣介石，力陳民營公司尤其是盧作孚的民生船運公司在大撤退中的卓越貢獻和為國犧牲的精神，請求政府予以表彰。黃炎培到了重慶，繼續積極從事職業教育活動，為抗日救亡奔走，鼓動成立了以救助難民為宗旨的“永川紙制品廠”；聯絡工商業企業家成立了遷川工廠聯合會，推選抗戰初期勇炸日本“出云艦”的上海實業家胡厥文擔任會長。黃炎培指示在上海的中華職業學校，要堅持愛國主義教育，敵偽政權不讓升國旗就堅持精神升旗。黃炎培邀請中共領導人周恩來參加“星期講座”，周恩來到了重慶巴蜀中學，向愛國青年們做了熱情洋溢的演講，他指出‘筆戰是槍戰的前驅，也是抗戰的后陣’。周恩來與黃炎培商量，利用中華職業學校在上海的留守力量，開辦了對上海的愛國青年進行愛國教育的“現代知識講座”短訓班。黃競武受邀擔任周恩來的臨時英文翻譯，使他進一步了解共產黨人的胸懷。從上海歸來的莊子云向黃炎培匯報上海辦學的情況，帶來王糾思的問候，黃炎培思念起了跟自己四十多年賢妻。1940年12月22日，五十九歲的王糾思患腦溢血在上海去世。黃炎培聲淚俱下寫了幾首悼念亡妻的詩篇。震驚世界的‘皖南事變’發生，周恩來在參政會上憤怒揭發國民黨頑固派的罪行，讓黃炎培為國家的命運感到十分痛心。